Bragantia
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Item Large-scale gene expression analysis reveals the role of primary metabolism regulation in resistance to Brazilian Pseudomonas coronafaciens pv. garcae in coffee(Instituto Agronômico (IAC), 2024-12-20) Schenk, Juliana Camargo Martinati; Rodrigues, Lucas Mateus Rivero; Arruda, Natália; Guimarães, Paula de Souza; Diniz, Leandro Cardamone; Rezende, Antonio Mauro; Destéfano, Suzete Aparecida Lanza; Padilha, Lilian; Maluf, Mirian Perez; Guerreiro Filho, OliveiroThis study investigated the response of arabica coffee plants to the pathogen Pseudomonas coronafaciens pv. garcae using RNA-seq technology. Susceptible and resistant coffee plants were inoculated with the bacteria, and leaf samples were collected at different time points for RNA sequencing. Seven genes related to different defense pathways were chosen for expression quantification in time-course experiments using infected leaves from resistant and susceptible plants, as well as non-infiltrated and water-infiltrated leaves as controls. The results obtained revealed that response mechanisms differ between genotypes and provide insights into the genetic basis of early defense in coffee plants against P. coronafaciens pv. garcae, offering potential strategies for genetic breeding.Item Sample size estimation of fruit maturation for Arabica’s coffee(Instituto Agronômico (IAC), 2025-01-31) Botega, Gustavo Pucci; Abrahão, Juliana Costa de Rezende; Botelho, Thiago Tavares; Botelho, Cesar Elias; Salvador, Guilherme Soares; Gonçalves, Flávia Maria AvelarThis study aimed at establishing the ideal sample size for evaluating the maturation cycle in Coffea arabica, and investigating the errors associated with different sample sizes, in addition to verifying the possibility of using the clustering method to separate genotypes according to the maturation stage. Two experiments were analyzed: one with F2:3 progenies using visual maturation assessment through fruit counting, and another with cultivars using image processing for maturation assessment. To determine the ideal sample size for this trait, we used the estimation of the errors associated with maturation, using the bootstrap technique. Subsequently, the K-means algorithm was tested as an alternative for clustering genotypes into maturation classes. The application of the bootstrap technique in order to estimate the error associated with maturation revealed that the adoption of a 450-mL sample size resulted in an associated error of approximately 5%, indicating that it is an adequate size for character assessment. The implementation of K-means as a clustering tool offers a promising perspective for Arabica coffee plant breeding programs. A more comprehensive analysis, which not only assesses the proportion of ripe fruits, but also considers the distribution of different maturation stages, provides a more accurate understanding of the maturation process. This allows a more precise identification of genotypes with the most suitable performance for different growing conditions, as well as enabling adjustments in harvest management and post-harvest processing, optimizing coffee quality.Item Contribution of mycorrhiza and phosphate-solubilizing fungi in coffee seedling growth in four soils with different fertility conditions(Instituto Agronômico (IAC), 2025-01-17) González-Osorio, Hernan; Sadeghian, Siavosh; Mira, Beatriz EugeniaPhosphorus (P) is a limiting nutrient for coffee seedlings. To meet this requirement, coffee growers usually apply di-ammonium phosphate (DAP), which is highly sensitive to local price fluctuations. The use of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and phosphate-solubilizing fungi (PSF) has been recommended, but the results derived from their application are inconsistent and uncertain, depending on soil fertility status. The response of AMF and PSF application in the plant growth of coffee seedlings during the nursery stage was evaluated in four non-sterile soils, which represent the most abundant type of soils in the coffee regions of Colombia: Eutropept, Dystropept, Fulvudand, and Ultisol. The treatments included a commercial AMF inoculum, PSF-Phlebia subserialis-CH4, and a consortium of AMF+PSF, at four P levels (0, 0.5, 1, and 2 g.plant-1 P2O5) using DAP fertilizer. Shoot dry weight (SDW) was affected by P applications in Fulvudand. In the other soils, a P-response occurred with 0.5 g.plant-1 , whereas 1 and 2 g.plant-1 of P2O5 caused a significant reduction in SDW. AMF increased SDW by 40% in Eutropept. The negative effect of higher P amounts was mitigated (> 70%) through PSF and AMF+PSF in Ultisol and Eutropept, respectively. In plants in which microorganisms increased SDW, the P concentration was 0.17 to 0.22%. The plant growth promotion of coffee seedlings during the nursery stage with AMF and/or PSF applications varied according to soil type and P amounts applied.Item Arbuscular mycorrhizal fungi inoculation for coffee seedling production with commercial and conventional substrates(Instituto Agronômico (IAC), 2023-05-22) Silveira, Adriana Parada Dias; Tristão, Fabrício Sales Massafera; Fernandes, Ana Olívia; Andrade, Sara Adrian Lopez; Cipriano, Mateus Aparecido PereiraCoffee seedlings are commonly produced on substrate composed of a mixture of soil and cattle manure, supplemented with chemical fertilizers. Alternatives to reduce production costs and produce seedlings of greater quality and health include the use of commercial organic substrates, which require less handling. The use of beneficial microorganisms such as arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) can be considered a good alternative for production of more vigorous coffee seedlings. The main goal of this study was to evaluate the effect of the inoculation of AMF isolates on coffee seedlings development in a commercial organic substrate (based on coconut fiber) and conventional substrate (mixture composed of soil and cattle manure compost). Ten AMF were tested: Rhizophagus irregularis, Glomus macrocarpum, Claroideoglomus etunicatum, Rhizophagus clarus, Glomus spp., Gigaspora margarita, Acaulospora morrowiae, Acaulospora scrobiculata, Acaulospora spp., and Dentiscutata heterogamma. Plant growth, shoot P content, mycorrhizal colonization, extraradical mycelium length, phosphatase activity, and photosynthetic pigments were evaluated. The effects of mycorrhization depended on both the inoculated fungal species and the substrate for seedling cultivation. Inoculation of G. margarita, Acaulospora spp., and Glomus spp. in the conventional substrate conferred the best growth plant responses, increasing shoot biomass by 160 to 320%. In the commercial substrate, the most efficient AMF were R. clarus, Glomus spp, A. morrowiae and A. scrobiculata, with up to 149% of shoot biomass increase. The commercial organic substrate and the inoculation of some of the AMF isolates were highly beneficial to coffee seedlings development and can replace the use of the conventional substrate. These results open new opportunities for the use of AMF as an inoculant to improve coffee seedling production in commercial organic substrates.Item Flutuação populacional do bicho-mineiro em cultivares de café arábica resistentes à ferrugem(Instituto Agronômico (IAC), 2005-10) Conceição, Celso Henrique Costa; Guerreiro-Filho, Oliveiro; Gonçalves, WallaceA intensidade de infestação pelo bicho-mineiro, Leucoptera coffeella (Guérin-Méneville) (Lepidoptera: Lyonetiidae) foi investigada nas cultivares Obatã IAC 1669-20 e Tupi IAC 1669-33, com resistência à ferrugem das folhas do cafeeiro, Hemileia vastatrix Berk. et Br., e Ouro Verde Amarelo IAC 4397, suscetível à doença, em ensaios de campo, localizados em Campinas (SP), Brasil. A incidência de ferrugem e a ocorrência de inimigos naturais da praga, assim como o enfolhamento das plantas, foram também observados nas três cultivares. As curvas de flutuação populacional obtidas para Obatã IAC 1669-20 e Tupi IAC 1669-33 revelaram maior incidência do bicho-mineiro entre abril e novembro. Já na cultivar Ouro Verde Amarelo IAC 4397, observaram-se dois picos de infestação, sendo o primeiro em abril-maio e o segundo em agosto-setembro. No entanto, a elevada percentagem de folhas minadas nas cultivares Tupi IAC 1669-33 e Obatã IAC 1669-20 em relação à Ouro Verde Amarelo IAC 4397 não é evidência de maior suscetibilidade à praga, mas sim devido à maior retenção foliar dessas cultivares, em conseqüência da resistência à ferrugem das folhas observada em ambas. De maneira oposta, na cultivar Ouro Verde Amarelo IAC 4397, os sintomas de ataque do bicho-mineiro ocorreram em menor nível especialmente devido a maior queda de folhas. Com base nas diferenças observadas entre as cultivares, sugere-se a adoção de estratégias distintas de manejo da praga.Item Radiação solar e saldo de radiação em cultivo de café a pleno sol e consorciado com banana ‘Prata Anã’(Instituto Agronômico (IAC), 2005-07) Pezzopane, José Ricardo Macedo; Pedro Júnior, Mário José; Gallo, Paulo BollerMedições da radiação solar global e do saldo de radiação foram realizadas em cafeeiros (Coffea arabica L.) cv. Icatu Vermelho IAC 4045, cultivados a pleno sol e consorciados com bananeira (Musa AAB) 'Prata Anã', no município de Mococa - SP (21º 28' S, 47º 01' W, altitude 665 m), durante o período de outubro de 2001 a setembro de 2002, com o objetivo de quantificar a atenuação da radiação solar e do saldo de radiação em sistema de produção de café consorciado. Os resultados obtidos mostraram diferenças nos elementos medidos nos dois sistemas de cultivo. Houve atenuação média dos valores de radiação solar global em cultivo de café consorciado com banana 'Prata Anã' da ordem de 21%, com variação mensal de 16% a 27%, tendo sido verificadas diferenças de atenuação da radiação solar nos diferentes pontos amostrais do sistema consorciado. Em relação ao saldo de radiação, verificou-se redução média de 16% nos valores diários no cultivo consorciado em comparação ao cultivo a pleno sol. O saldo de radiação representou 50% da radiação solar global no cultivo a pleno sol, com variação mensal de 34% a 62%, e no cultivo consorciado o saldo de radiação representou 53% da radiação solar global, com variação de 35 a 38%.Item Trocas gasosas e fluorescência da clorofila em seis cultivares de cafeeiro sob estresse de alumínio(Instituto Agronômico (IAC), 2005-07) Konrad, Maria Luiza Freitas; Silva, José Aliçandro Bezerra da; Furlani, Pedro Roberto; Machado, Eduardo CarusoEm experimento desenvolvido em casa de vegetação e em câmara de crescimento avaliou-se o efeito do alumínio (Al) na fotossíntese de seis cultivares de cafeeiro. As plantas foram cultivadas em solução nutritiva aerada continuamente, contendo duas concentrações de Al, 0 e 0,148 mmol L-1, fornecidas como Al2(SO4)3. Após 97 dias mediram-se as taxas de assimilação de CO2 (A) e transpiração (E), a condutância estomática (gs), a concentração interna de CO2 (Ci), eficiência instantânea de carboxilação (Fc) e variáveis de fluorescência da clorofila. Em todas as cultivares, a presença de Al causou quedas significantes em A, gs, Fc, ocorrendo aumento em Ci. Também se observou aumento significativo na fluorescência basal (Fo) e queda na eficiência quântica máxima do fotossistema II (Fv/Fm), sugerindo injúrias na estrutura dos tilacóides causadas pelo Al. Na curva de indução de fotossíntese, observou-se que o Al causou queda no coeficiente de extinção fotoquímica da fluorescência e aumento no coeficiente de extinção não fotoquímico. Os resultados desse estudo indicaram que a queda de A foi devida à queda da condutância estomática, nas atividades bioquímicas e fotoquímicas.Item Qualidade do grão e da bebida em cafeeiros tratados com lodo de esgoto(Instituto Agronômico (IAC), 2005-01) Martins, Daniela Ribeiro; Camargo, Otávio Antonio de; Bataglia, Ondino CleanteO objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da aplicação de lodo de esgoto (LE) em plantação comercial de café, sobre a qualidade de bebida, avaliada pela atividade da enzima polifenoloxidase (PFO) e por análise sensorial. O trabalho foi realizado em condições de campo, na Fazenda Santa Elisa, localizada no município de Patrocínio Paulista (SP), em 2001 e 2002. A variedade de café usada em todos os talhões foi Acaiá. O plano de trabalho constou da análise de talhões comerciais em seis agrupamentos, conforme as doses e freqüências de aplicação de lodo de esgoto, denominados tratamentos. Todos os talhões receberam adubação mineral, conforme a análise de solo, e assim foram definidos os diferentes tratamentos. Tratamento 1: talhões B2, B3, B4 e B5, sem aplicação de lodo de esgoto; tratamento 2: talhões C5 e C6, 9,0 T ha-1 de LE (1998), 4,8 t ha-1 (1999) ,11,8 t ha-1 (2000) e 4,2 t ha-1 (2002); tratamento 3: talhões D5 e D6, 9,0 t ha-1 de LE (1998), 4,8 t ha-1 (1999), 11,8 t ha-1 (2000) e 4,2 t ha-1 (2002); tratamento 4: talhões E1 e E2, 9,0 t ha-1 de LE (1998) e 4,2 t ha-1 (2002); tratamento 5: talhões E3 e E4, 9,0 t ha-1 de LE (1998), 4,8 t ha-1 (1999) e 4,2 t ha-1 (2002); tratamento 6: talhões H1, H2, H3, H4 e H5, 22,4 t ha-1 (1999). Foi realizada análise visual dos grãos quanto ao tamanho, e a qualidade da bebida, avaliada pela prova de xícara e atividade da enzima polifenoloxidase. A aplicação de lodo de esgoto não afetou a qualidade da bebida nas condições deste experimento. Houve baixa concordância entre as classificações obtidas pela atividade da polifenoloxidase e pela prova de xícara, para os dois anos analisados.Item Influências ambientais no rendimento intrínseco do café(Instituto Agronômico (IAC), 2005-01) Gaspari-Pezzopane, Cristiana de; Medina Filho, Herculano Penna; Bordignon, Rita; Siqueira, Walter José; Ambrósio, Luís AlbertoEstudou-se a influência de alguns fatores ambientais no Rendimento Intrínseco (RI) do café, relação percentual entre a massa de dois grãos normais tipo chato e a do respectivo fruto que os contêm. Verificaram-se decréscimos até de 18% nos valores de RI de frutos entre os estádios de maturação de verde a passa, e em sete localidades diferentes ocorreram variações significativas até de 12%. Em dois locais diferentes no mesmo município, o RI variou até em 6%, tendo sido observadas diferenças de 2% entre quatro lotes diferentes de um mesmo local. Em um mesmo lote experimental observaram-se diferenças até em 3,7% no RI de diferentes plantas da mesma cultivar. Variações de altitude até de 330 m, na mesma localidade, correlacionaram-se positivamente com variações até em 4,4% no RI. Quanto à influência da posição dos frutos na planta, verificou-se que o RI diminui, até em 4,4% à medida que os frutos se afastam do ramo ortotrópico, em 1,5% na exposição Leste e em 0,5% nas posições superiores e medianas da planta. Pelos resultados, verifica-se considerável influência ambiental afetando essa característica. Para fins de melhoramento genético, a seleção, para a característica RI, deve ser realizada com base em amostras padronizadas quanto à maturação, posição na planta e representar pelo menos dez plantas de progênies uniformes avaliadas no mesmo lote experimental.Item Fungos micorrízicos arbusculares na formação de mudas de cafeeiro, em substratos orgânicos comerciais(Instituto Agronômico (IAC), 2006-10) Tristão, Fabrício Sales Massafera; Andrade, Sara Adrian Lopez de; Silveira, Adriana Parada Dias daRealizou-se um experimento, em casa de vegetação, em arranjo fatorial 9 x 4, com o objetivo de avaliar o efeito de substratos orgânicos comerciais e inoculação de fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) no desenvolvimento de mudas de cafeeiro, cultivar 'Catuaí Amarelo', IAC 62. Utilizaram-se substratos à base de fibra de coco (Golden Mix 11, Golden Mix 47 e Golden Mix 80), casca de pinus (Rendmax, Vida Verde com adubação, Vida Verde sem adubação e Terra do Paraíso), solo puro e solo + esterco (70% e 30%,v/v), inoculando-se os FMAs Glomus intraradices, Glomus etunicatum e Gigaspora margarita. Manteve-se um tratamento sem inoculação. Aos 200 dias após transplante avaliaram-se: altura, diâmetro do caule, número de folhas, matéria seca da parte aérea, matéria fresca da raiz, teor de fósforo na parte aérea, colonização radicular, comprimento do micélio externo, atividade da fosfatase ácida e teores de pigmentos fotossintetizantes nas folhas do cafeeiro. Independentemente da micorrização, o melhor crescimento das mudas foi obtido no substrato Vida Verde sem adubação. Os melhores efeitos da micorrização foram constatados nas plantas colonizadas por G. margarita e crescidas nos substratos convencional (solo + esterco) e Vida Verde com adubação, nas quais se verificaram mais eficácia na utilização de P, o que reverteu em maior crescimento e produção de biomassa, resultando em maior eficiência simbiótica. No substrato solo + esterco, a micorrização favoreceu a concentração de pigmentos fotossintetizantes e diminuiu a atividade da fosfatase ácida nas folhas do cafeeiro.