Estudo da diversidade genética, por meio de marcadores moleculares de uma população de Coffea canephora var. Conilon

Abstract

O Coffea canephora é uma das duas espécies cultivadas comercialmente no mundo. A produção nacional é muito importante, para a safra de 2013 a produção é estimada em aproximadamente 26% da produção mundial. O Coffea canephora possui grande variabilidade genética devido sua alogamia. Por outro lado essa variabilidade genética é importante para os programas de melhoramento do cafeeiro, pois fornece uma fonte de novos genes. O estudo molecular da diversidade genética vem se demonstrando cada vez mais eficiente, necessário e refinado, uma vez que as técnicas moleculares estão evoluindo e os descritores morfológicos estão se tornando insuficientes para a descrição de um indivíduo. Os marcadores moleculares microssatélites ou SSR (“Simple Sequence Repeats”) são marcadores co-dominantes, utilizados com uma frequência cada vez maior para estudos de diversidade de populações. O objetivo desse trabalho foi avaliar a diversidade genética de genótipos do Banco Ativo de Germoplasma – BAG do Incaper, bem como uma fração de descendentes mantidos no campo da EMBRAPA Cerrados. Para ambos objetivos, marcadores SSR foram utilizados e a fragmentos do produto da PCR, analisados em sequenciador automático (ABI 3130xl). Com esses resultados foi possível observar ampla variabilidade genética entre os parentais e seus descendentes. Foi possível concluir com a análise de paternidade, que a planta “PAR60” é a mais recorrente na população, com 24,44% de frequência. Esses marcadores foram também utilizados num estudo de caso visando a analise de uma planta isolada de C. canephora suspeita de se reproduzir por autofecundação. Os resultados preliminares obtidos mostram que essa planta não é autogama mais se reproduz de maneira alógama.

The Coffea canephora is one of the two species commercially cultivated in the world. National production is very significant, as it is estimated for the harvest of 2013, a share of 26 % of the total Brazilian processed coffee. C. canephora has a large genetic variability of plants because they are alogamous. On the other hand this genetic variability is of importance for the genetic improvement programs of coffee, because it is the source of new genes. The molecular study of coffee genetic diversity is becoming increasingly efficient, necessary and refined, since the molecular techniques are evolving and the morphological descriptors are becoming inadequate for the description of an individual. The microsatellite molecular markers or SSR (Simple Sequence Repeats), are co-dominant markers, used with increasing frequency for studies of diverse populations. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of genotypes from the Active Germplasm Bank - BAG of Incaper as well as a fraction of offspring generated by such parents, which are maintained in the experimental field of Embrapa Cerrados. Another objective was the analysis of paternity in the population. For both objectives, SSR markers have been used and fragments of the PCR product, analyzed in automatic sequencer (ABI 3130xl). With the results, we observed that there is a large genetic variability among the parents, and its offspring. It was possible to conclude from paternity-analysis results, that the plant "PAR60" was the most recurrent in the population, with 24.44 % of the frequency. These markers were also used in a study aiming to analyze the case of an isolated plant of C. canephora suspected to reproduce by self-fertilization. Preliminary results show that this plant is not autogamous but reproduces so allogama.