Identificação de marcador molecular ligado ao porte de planta em C. arabica

Abstract

A metodologia de RAPD foi utilizada para identificação de marcador molecular, relacionado com a característica porte da planta em C. arabica. DNA de dez plantas de porte alto e dez de porte baixo, obtidas de uma geração F2, foram extraídos e, após quantificação, reunidos em "bulk". Os bulks de DNA de plantas de porte baixo e porte alto foram utilizados para amplificação com 120 primers de RAPD. Três primers que sugeriram a presença de marcador específico para porte das plantas foram amplificados com DNA das dez plantas de porte baixo e dez plantas de porte alto, individualmente. Um dos marcadores com aproximadamente 1.2 kb, sugeridos nos bulks foi confirmado, ocorrendo em todas as plantas que apresentavam porte baixo. Nenhuma das plantas de porte alto apresentou este marcador, sugerindo fortemente uma associação com a característica em questão. Em continuidade ao projeto este marcador será clonado e sequenciado para verificar sua relação com a característica porte da planta. Após o sequenciamento, as 24 bases do início e do final do fragmento serão utilizadas para construção de dois primers de PCR específicos (SCAR) que serão utilizados para seleção assistida de plantas de porte baixo.

RAPD methodology was used in the identification of molecular markers related to plant stature in C. arabica. DNA of ten F2 plants with short and tall stature was extracted. After quantification, tem samples were joined in a bulk of short plants and other of tall plants. The DNA of the two bulks was amplified with 120 RAPD primers. Three primers, which suggested the presence of a specific molecular marker, were amplified with DNA of ten individual short plants and ten tall plants. One of the markers with 1.2 kb in size, was amplified only in the short plants, suggesting that it is associated with this characteristic. In continuity, this marker will be cloned and its sequence determined to define its relationship with the character. Additionally, two specific PCR primers (SCAR) will be designed to screening for short plants.