DIVERSIDADE GENÉTICA DE GENÓTIPOS DE CAFÉ CANÉFORA POR MEIO DE MARCADORES MICROSSATÉLITE

Abstract

O germoplasma de café canéfora (Coffea canephora), cultivado comercialmente ou conservado nas instituições brasileiras de pesquisa agropecuária, apresenta ampla variabilidade fenotípica, todavia são escassos os estudos que comparam acessos de diferentes coleções. Assim, esse trabalho objetivou avaliar a diversidade genética do germoplasma de C. canephora oriundo de distintas instituições de pesquisa, usando marcadores microssatélites. Foram avaliados 128 acessos de C. canephora, conservados na Estação Experimental da Embrapa Rondônia, em Ouro Preto do Oeste-RO, provenientes dos Bancos de Germoplasma (BAGs) do IAC (43 acessos), EPAMIG/UFV (11 acessos), INCAPER (39 acessos) e de coletas em áreas de cultivo no próprio Estado (35 acessos). Acessos de C. racemosa, C. eugenioides, C. liberica, C. arabica e Híbrido de Timor foram incluídos na análise. Foram utilizados 22 primers microssatélites desenvolvidos a partir das seqüências do Projeto Brasileiro do Genoma Café. A dissimilaridade entre os acessos foi calculada por meio do índice de coincidência não-ponderado e representada em dendrograma, baseado no método UPGMA. Por meio dos microssatélites foi detectado elevado nível de polimorfismo, o que permitiu a individualização de todos os acessos. As demais espécies analisadas formaram um grupo a parte. Entre os acessos de C. canephora, verificou-se a formação de dois grupos, sendo o primeiro composto por genótipos do tipo Conilon e o segundo por genótipos do tipo Robusta. Os acessos do INCAPER e da Embrapa Rondônia formaram dois subgrupos dentro do grupo Conilon, sendo que a diversidade no BAG da Embrapa Rondônia foi maior do que no BAG do INCAPER. No grupo dos Robustas, foi observada ampla diversidade, não havendo distinção entre as coleções do IAC e da EPAMIG/UFV. A técnica de microssatélites possibilitou um satisfatório entendimento da diversidade genética entre os acessos de diferentes coleções, mostrando-se essencial para complementar estudos de caracterização de germoplasma de Coffea canephora.

Robusta coffee (Coffea canephora) germplasm, commercially grown or maintained in the Brazilian institutions of agricultural research, shows wide phenotypic variability, nevertheless there are few studies comparing accessions from different collections. This study aimed to evaluate the genetic diversity in germplasm of C. canephora from different research institutions, using microsatellite markers. It was evaluated 128 accessions of C. canephora, maintained at the Experimental Station of Embrapa Rondônia, in Ouro Preto do Oeste-RO, obtained from germplasm collections (BAGs) of the IAC (43 accessions), EPAMIG/UFV (11 accessions), INCAPER (39 accessions) and also collected in cultivated areas in Rondônia State (35 accessions). Accessions of C. racemosa, C. eugenioides, C. liberica, C. arabica and Híbrido de Timor were included in the analysis. Twenty two microsatellite primers designed from sequences of the Brazilian Coffee Genome Project were used. The dissimilarity between accessions was calculated as the complement of unweighted matching index and represented in a dendrogram, based on UPGMA method. Microsatellites detected high level of polymorphism, which allowed the individualization of all accessions. The other species formed an isolated cluster. Among the accessions of C. canephora, two groups were formed: the first was composed by Conilon genotypes and the second by Robusta genotypes. The accessions of Embrapa Rondônia and INCAPER formed two subgroups within Conilon group, and the diversity in the BAG of Embrapa Rondônia was higher than in the BAG of INCAPER. In Robusta group, wide diversity was observed, with no distinction between the collections of the IAC and EPAMIG/UFV. Microsatellites promoted a good understanding of the genetic diversity among accessions from different collections and it showed as an essential tool to complement studies in characterization of Coffea canephora germplasm.