Construção de um mapa parcial de ligação gênica em café utilizando marcadores RAPD

Abstract

Um mapa parcial de ligação gênica para Coffea arabica L. foi elaborado com a utilização de uma população segregante RC1 oriunda do cruzamento entre o Híbrido de Timor e ‘Catuaí Amarelo’. Foram avaliados 112 marcadores RAPD polimórficos e consistentes, dos quais 85 apresentaram segregação na proporção esperada de 1:1 (P>0,05) e 27 mostraram desvio nessa proporção, não sendo aproveitados na elaboração do mapa. Quinze marcadores não se mostraram ligados, enquanto os 70 restantes formaram nove grupos de ligação, cobrindo 512,2 cM. A maioria dos grupos obtida apresentou boa densidade de marcadores, em que o maior intervalo entre dois marcadores foi de 30,4 cM e houve um total de sete intervalos que excederam 20 cM. A obtenção de novos marcadores RAPD polimórficos e a inclusão de outros marcadores moleculares, principalmente AFLPs e microssatélites, poderão saturar esses intervalos e/ou formar novos grupos de ligação, além de incluir os marcadores não ligados, melhorando a cobertura do genoma e permitindo determinar possíveis relações homeólogas entre os grupos de ligação de Coffea arabica, o que tornará o mapa ainda mais informativo.

A genetic linkage partial map of Coffea arabica L. was elaborated with use of a RC1 segregant population originated from crossing between the Híbrido de Timor and 'Catuaí Amarelo'. It were assessed 112 polymorphic and consistent RAPD markers, of the which 85 presented segregation in the expected ratio of 1:1 (P>0,05) and 27 showed deviation in that ratio, not being taken advantage in the map elaboration. Fifteen markers were not shown linked, while the remaining 70 formed nine linkage groups covering 512,2 cM. The most of the groups obtained it presented good density of markers, in that the largest interval among two markers was of 30,4 cM and there was a total of seven intervals that exceeded 20 cM. The obtaining of new polymorphic RAPD markers and the inclusion of other molecular markers, mainly AFLPs and microsatellites, it can saturate these intervals and, or to form new linkage groups, besides including the unlinked markers, improving the covering of the genome and allowing to determine possible homeologous relationships among the linkage groups of Coffea arabica, what will still turn the map more informative.