Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee

dc.contributor.author	Pereira, Gabriella Santos
dc.contributor.author	Padilha, Lilian
dc.contributor.author	Pinho, Edila Vilela Resende Von
dc.contributor.author	Teixeira, Rita de Kássia Siqueira
dc.contributor.author	Carvalho, Carlos Henrique Siqueira de
dc.contributor.author	Maluf, Mirian Peres
dc.contributor.author	Carvalho, Bruna Line de
dc.date.accessioned	2018-11-19T11:39:51Z
dc.date.available	2018-11-19T11:39:51Z
dc.date.issued	2011-12
dc.identifier.citation	PEREIRA, G. S. et al. Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.46, n.12, p.1650-1656, dez. 2011.	pt_BR
dc.identifier.issn	1678-3921
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.1590/S0100-204X2011001200010	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.sbicafe.ufv.br/handle/123456789/10387
dc.description.abstract	The objective of this work was to analyze coffee (Coffea arabica) genotypes resistant to the coffee leaf miner (Leucoptera coffeella) using microsatellite markers. Sixty‐six loci were evaluated, of which 63 were obtained from the Brazilian Coffee Expressed Sequence Tag (EST) database. These loci were amplified in bulks of individuals from F 5 progenies of 'Siriema' (C. arabica x C. racemosa) resistant and susceptible to the insect, in eight samples of C. racemosa, and in a F 6 population of 'Siriema' with 91 individuals segregating for resistance to the leaf miner. Polymorphisms were verified for two simple sequence repeat (SSR) loci in bulks of the susceptible progenies. The two polymorphic alleles were present in around 70% of the susceptible genotypes in F 5 and in approximately 90% of the susceptible individuals in F 6 . However, the polymorphic EST‐SSR markers among populations contrasting for resistance to leaf miner were not correlated to the evaluated characteristics. SSR markers show inter‐ and intraspecific polymorphism in C. arabica and C. racemosa.	pt_BR
dc.description.abstract	O objetivo deste trabalho foi analisar genótipos de cafeeiro (Coffea arabica) resistentes ao bicho‐mineiro (Leucoptera coffeella), com uso de marcadores microssatélites. Foram avaliados 66 locos, dos quais 63 foram obtidos do banco de sequências expressas (EST) de café. Esses locos foram amplificados em “bulks” de progênies F 5 de 'Siriema' (C. arabica x C. racemosa) resistentes e suscetíveis ao ataque da praga, em oito acessos de C. racemosa, e em uma população F 6 de 'Siriema' com 91 indivíduos que segregam para resistência ao bicho‐mineiro. Os polimorfismos foram verificados em dois locos de marcadores microssatélites (SSR), nos “bulks” das progênies suscetíveis. Os dois alelos polimórficos estiveram presentes em torno de 70% dos genótipos suscetíveis em F 5 e em, aproximadamente, 90% dos indivíduos suscetíveis em F 6 . Entretanto, os marcadores EST‐SSR polimórficos entre populações contrastantes para a resistência ao bicho‐mineiro não foram correlacionados às características avaliadas. Os marcadores SSR apresentam polimorfismo inter e intraespecífico em C. arabica e C. racemosa.	pt_BR
dc.format	pdf	pt_BR
dc.language.iso	en	pt_BR
dc.publisher	Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa	pt_BR
dc.relation.ispartofseries	Pesquisa Agropecuária Brasileira;v.46, n.12, p.1650-1656, 2011
dc.rights	Open Access	pt_BR
dc.subject	Coffea arabica	pt_BR
dc.subject	Leucoptera coffeella	pt_BR
dc.subject	EST‐SSR	pt_BR
dc.subject	Genótipos	pt_BR
dc.subject.classification	Cafeicultura::Genética e melhoramento	pt_BR
dc.title	Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee	pt_BR
dc.title	Marcadores microssatélites na análise de resistência ao bicho‐mineiro em café arábica	pt_BR
dc.type	Artigo	pt_BR