Navegando por Autor "Rocha, Cynthia de Melo"

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    Identificação de genes expressos na interação compatível Hemileia vastatrix - cafeeiro por meio de sequenciamento de cDNAs.
    (2010-03-30) Rocha, Cynthia de Melo; Brommonschenckel, Sérgio Hermínio; Universidade Federal de Viçosa
    Mudanças no padrão de expressão de genes no patógeno e na planta hospedeira são fatores determinates do fenótipo da interação planta-patógeno. Desta maneira, o objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar genes do cafeeiro e de Hemileia vastatrix expressos em uma interação compatível por meio do sequenciamento de clones de uma biblioteca de cDNA de tecido infectado. A biblioteca de cDNA foi construída a partir de mRNA isolado de folhas do cafeeiro infectadas com H. vastatrix aos 25 dias após a inoculação. Foi efetuado o sequenciamento de passagem única de 8274 clones da biblioteca de cDNA da interação C. arabica e H. vastatrix e 6479 etiquetas de seqüências expressas (ESTs) foram obtidas. Dentre elas, 5091 (78,6%) sequências representam genes de plantas depositadas no GenBank/NCBI e 562 (8,7%) sequências representam genes de fungos e 826 (12,7%) representam genes ainda não caracterizados (e-value 10-5). O alinhamento realizado com as 5091 sequências que apresentaram similaridade com genes de plantas resultou em 1891 sequências únicas, constituídas por 887 contíguos e 1004 singletos. A maioria dessas sequências representa genes com função desconhecida. Dentre as sequências com similaridade a genes que codificam proteínas com funções conhecidas, verificou-se maior número de genes que codificam proteínas ribossomais, seguido do grupo de genes que codificam proteínas envolvidas no metabolismo primário e produção de energia, sendo que 27 sequências apresentaram similaridade a genes que codificam proteínas relacionadas ao processo de defesa tais como os fatores de transcrição WRKY, proteínas cinases, fosfatases, metalotioneína, PRs, quitinases, -1,3- glucanase, enzimas como fenilalanina-amônia liase, glutationa S-transferase. Das 562 sequências que apresentaram similaridade a genes de fungos, 254 foram sequências únicas, representadas por 79 contíguos e 175 singletos. A maioria das sequências representou genes que codificam proteínas com função conhecida. O maior grupo dos genes com função conhecida codifica proteínas ribossomais, seguido do grupo de genes que codifica proteínas envolvidas no metabolismo primário e produção de energia, sendo que 13 sequências apresentaram similaridade a genes relacionados ao processo de infecção tais como PIG1, PIG4 e PIG8 (Planta-induced genes), RTP1 (Rust transferred protein 1), proteínas cinases e MRPs (Multidrug resistance- associated protein 1 transporter). Observa-se ainda que ESTs representando genes não caracterizados e não depositados somaram 52% do total. Esses genes podem incluir genes da planta e genes do fungo, neste caso possíveis efetores ainda não caracterizados. A construção da biblioteca de cDNA de tecidos infectados da interação cafeeiro – H. vastatrix foi eficiente para identificar possíveis genes da planta e do patógeno expressos nessa interação, porém estudos funcionais deverão ser realizados para confirmar e quantificar o papel de cada um desses genes na interação.