Navegando por Autor "Pereira, Gonçalo A. G."

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    Identificação de polimorfismos de nucleotídeos únicos em montagem de ESTs de três espécies de café
    (2007) Vidal, Ramon O.; Carazzolle, Marcelo F.; Sampaio, Cláudio L. M.; Costa, Gustavo G. L.; Formighieri, Eduardo F.; Pot, David; Mondego, Jorge M. C.; Pereira, Gonçalo A. G.; Embrapa - Café
    A partir do seqüenciamento de ESTS de três espécies de café, Coffea arabica, Coffea canephora e Coffea racemosa, foi aberta uma série de possibilidades para o estudo de características diferenciais entre essas espécies. Características fenotípicas de interesse agronômico podem ser estudadas molecularmente através da análise de transcritos dessas três espécies e também através do mapeamento de um conjunto de genes alvos para programas de melhoramento genético. Neste trabalho foi realizado um agrupamento de ESTs das três espécies por similaridade visando estudo de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs). A partir de parâmetros de similaridade (>95%) e sobreposição (>100 bp) foram construídos 15.885 contigs, e nestes observa-se uma freqüência de 0,47 SNPs a cada 100 pb. Os resultados foram armazenados para consulta visando futuros estudos de variabilidade em indivíduos de cada espécie e entre estas três espécies.