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Estudo da diversidade genética de uma população de Coffea canephora var. conilon por meio de marcadores moleculares do tipo SSR
(Embrapa Café, 2013) Alekcevetch, Jean Carlos; Carneiro, Fernanda de Araújo; Rêgo, Érica Cristina da Silva; Guerra, Antonio Fernando; Bartholo, Gabriel Ferreira; Ferrão, Maria Amélia Gava; Fonseca, Aymbiré Francisco Almeida da; Marraccini, Pierre; Andrade, Alan Carvalho
O Coffea canephora é uma das duas espécies cultivadas comercialmente no mundo. A produção nacional é muito importante, com uma produçao estimada a cerca de 26% do total de café beneficiado produzido no mundo para a safra de 2013. O estudo molecular da diversidade genética vem se demonstrando cada vez mais eficiente, necessário e refinado, uma vez que as técnicas moleculares estão evoluindo e os descritores morfológicos estão se tornando insuficientes para a descrição de um indivíduo. Os marcadores moleculares microssatélites ou SSR (“Simple Sequence Repeats”), são marcadores co-dominantes, utilizados com uma frequência cada vez maior para estudos de diversidade de populações. O objetivo desse trabalho foi avaliar a diversidade genética de cerca de 48 clones parentais de Coffea canephora var. Conilon presentes no Banco Ativo de Germoplasma – BAG do Incaper, bem como uma população de 266 plantas de Coffea canephora var. Conilon, correspondentes a uma descendência gerada por tais parentais, e mantidas no campo experimental da Embrapa Cerrados. O DNA genomico dessas plantas foi extraido, e analisado por PCR usando marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR). Os produtos de PCR foram analisados por meio do sequenciador automático (ABI 3130xl) para avaliar o tamanho dos fragmentos amplificados. Esses resultados permitiram demostrar que existe uma ampla variabilidade genética entre as plantas parentais e aquelas da população descendente. Os resultados permitiram também realizar uma análise de paternidade, utilizando-se o software Cervus, sendo possível identificar o parental com maior ocorrência (24,44% de frequência) na população descendente.
Estudo da diversidade genética, por meio de marcadores moleculares de uma população de Coffea canephora var. Conilon
(Universidade Federal de Lavras, 2013-02-27) Alekcevetch, Jean Carlos; Andrade, Alan Carvalho
O Coffea canephora é uma das duas espécies cultivadas comercialmente no mundo. A produção nacional é muito importante, para a safra de 2013 a produção é estimada em aproximadamente 26% da produção mundial. O Coffea canephora possui grande variabilidade genética devido sua alogamia. Por outro lado essa variabilidade genética é importante para os programas de melhoramento do cafeeiro, pois fornece uma fonte de novos genes. O estudo molecular da diversidade genética vem se demonstrando cada vez mais eficiente, necessário e refinado, uma vez que as técnicas moleculares estão evoluindo e os descritores morfológicos estão se tornando insuficientes para a descrição de um indivíduo. Os marcadores moleculares microssatélites ou SSR (“Simple Sequence Repeats”) são marcadores co-dominantes, utilizados com uma frequência cada vez maior para estudos de diversidade de populações. O objetivo desse trabalho foi avaliar a diversidade genética de genótipos do Banco Ativo de Germoplasma – BAG do Incaper, bem como uma fração de descendentes mantidos no campo da EMBRAPA Cerrados. Para ambos objetivos, marcadores SSR foram utilizados e a fragmentos do produto da PCR, analisados em sequenciador automático (ABI 3130xl). Com esses resultados foi possível observar ampla variabilidade genética entre os parentais e seus descendentes. Foi possível concluir com a análise de paternidade, que a planta “PAR60” é a mais recorrente na população, com 24,44% de frequência. Esses marcadores foram também utilizados num estudo de caso visando a analise de uma planta isolada de C. canephora suspeita de se reproduzir por autofecundação. Os resultados preliminares obtidos mostram que essa planta não é autogama mais se reproduz de maneira alógama.