ANÁLISE DE EXPRESSÃO E POLIMORFISMO NUCLÉICOS DE GENES CANDIDATOS PARA A TOLERÂNCIA À SECA EM CAFEEIRO

Abstract

O presente trabalho teve como objetivos (i) analisar a expressão de genes candidatos (GC), que foram previamente identificados em plantas de Coffea canephora,e agora analisar a expressão em plantas de Coffea arabica cultivadas no campo e submetidas e não submetidas ao estresse hídrico e (ii) avaliar a diversidade genética de alguns GCs por meio da busca dos polimorfismos nucléicos. Os experimentos de expressão gênica foram realizados com os cultivares IAPAR59 (tolerantes à seca) e Rubi (sensível à seca) de C. arabica cultivados com e sem irrigação durante a estação seca. As folhas foram amostradas no ano de 2008 foram utilizadas para analisar a expressão de GCs por PCR quantitativo em tempo real (qPCR). Em paralelo, seqüências gênicas correspondentes aos GC foram clonadas e seqüenciadas a partir do DNA genômico de diferentes espécies, clones e cultivares de cafeeiro. Os polimorfismos foram identificados e permitiram de definir os haplótipos encontrados nos genótipos estudados.

This study aimed to (i) analyze the expression of candidate genes (CG), that were previously identified in plants of Coffea canephora, and now analyze their expression in plants of Coffea arabica grown in the field and submitted and not submitted to water stress and (ii) evaluate the genetic diversity of some GCs through the searching for nucleic polymorphisms. The gene expression experiments were performed with IAPAR59 cultivars (drought tolerant) and Rubi (drought sensitive), both varieties of C. arabica that grown with and without irrigation during the dry season. The leaves were sampled during 2008 and were used to analyze the expression of sGC by real time quantitative PCR (qPCR). At the same time, gene sequences corresponding to the GC were cloned and sequenced from the genomic DNA of different species, clones and cultivars of coffee. The polymorphisms were identified and allowed the definition of the haplotypes found in the genotypes studied.