A estrutura genética populacional de Hemileia vastatrix foi determinada usando o marcador AFLP em 91 isolados coletados em lavouras cafeeiras de Minas Gerais, Espírito Santo e São Paulo. Após amplificações seletivas, usando quatro combinações de primers (EcoRI/MseI), foram analisados 100 fragmentos polimórficos. Cada isolado apresentou um padrão único de alelos AFLP, constatando-se alta diversidade genotípica. A similaridade genética entre os isolados de H. vastatrix variou de 0,08 a 0,70, indicando alta variabilidade genética. Pela análise de agrupamento não foi observado à formação de grupos entre isolados do mesmo hospedeiro e origem geográfica. Não houve correlação entre distância genética e geográfica entre os isolados (r = 0,307, P = 0,234). Foi observada baixa diferenciação genética (GST = 0,026) entre as populações de H. vastatrix divididas por hospedeiros (Coffea arabica, C. canephora e Híbrido de Timor/Icatu). Os índices de diversidade gênica de Nei (HT, HS e GST) não mostraram diferença significativa entre as populações de H. vastatrix subdivididas por região geográfica. A análise de variância molecular (AMOVA) mostrou que a maior variância genética (99,56%) encontra-se dentro das populações do patógeno. O alto nível de diversidade genotípica encontrado entre os isolados sugere que as populações de H. vastatrix analisadas não são consistentes com a reprodução clonal e não estão estruturadas com relação ao hospedeiro e a origem geográfica. Os resultados obtidos demonstram que o fungo apresenta alto potencial evolutivo.
The population structure of Hemileia vastatrix was determined using AFLP markers in 91 isolates collected from coffee plantations in Minas Gerais, Espírito Santo and São Paulo. After selective amplification using four primers combinations (EcoRI/MseI), 100 polymorphic fragments were analyzed. Each isolate presented a unique pattern of AFLP alleles, accounting for high genotype diversity. The genetic similarity between the H. vastatrix isolates ranged from 0.08 to 0.70 indicating high genetic variability. Cluster analysis revealed that there was no formation of clusters between isolates of the same geographical origin and host. There was no correlation between genetic and geographical distance between the isolates (r = 0.307, P = 0.234). Low genetic differentiation (GST = 0.026) was observed among the populations divided on the host basis (Coffea arabica, C. canephora e Híbrido de Timor/Icatu). The genetics diversity index of Nei (HT, HS and GST) showed no significant difference among the H. vastatrix populations subdivided on the basis of geographical region. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed that the major (99.56 %) genetic variance is found within the pathogen populations. The high genotype diversity found indicated that the H. vastatrix populations are not consistent with clonal reproduction and unstructured with regards to the host and geographical origin. The results obtained suggest that the fungus has high evolutive potential.