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Item IPR Pérola: Dwarf Arabica coffee cultivar with high resistance to leaf rust and large beans(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2024-10-04) Sera, Gustavo Hiroshi; Sera, Tumoru; Mariucci Junior, Valdir; Shigueoka, Luciana Harumi; Bortolato, Kawana SilvaIPR Pérola is a Coffea arabica cultivar developed from a cross between IAPAR 59 and Mundo Novo IAC 376-4. It features a dwarf-medium size, high yield, excellent cup quality, a medium-early ripening cycle, and large beans. Additionally, it boasts high resistance to coffee leaf rust.Item IPR Alvorada – Dwarf Arabica coffee cultivar with high yield(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2024-09-25) Sera, Gustavo Hiroshi; Sera, Tumoru; Mariucci Junior, Valdir; Harumi, LucianaIPR Alvorada is a Coffea arabica cultivar with C. canephora introgression, developed from a cross between IAPAR 59 and Mundo Novo IAC 376-4. This cultivar has a dwarf-medium size, high yield, good cup quality, strong vegetative vigor, a medium fruit ripening cycle, and slight resistance to coffee leaf rust.Item Métodos ótimos de seleção genética no melhoramento do cafeeiro arábica(Embrapa Café, 2024-05) Resende, Marcos Deon Vilela de; Alves, Rodrigo Silva; Caixeta, Eveline Teixeira; Oliveira, Antonio Carlos Baião de; Pereira, Antonio Alves; Mariz, Bruna LopesOs principais fatores que ditam o sucesso de um programa de melhoramento são: (i) eficiência no processo seletivo (métodos ótimos de identificação e seleção de indivíduos superiores); (ii) estratégia adequada de melhoramento (método de seleção recorrente e delineamento de cruzamento para a criação de novos indivíduos superiores); (iii) curtas gerações de melhoramento, ou seja, seleção precoce maximizando o ganho genético por unidade de tempo. Este documento desenvolve a teoria e realiza recomendações práticas acerca desses fatores na cultura do cafeeiro arábica.Item Caracterização morfoagronômica de acessos de Coffea arabica L(Universidade Federal de Viçosa, 2009-12-18) Leão, André Pereira; Sakiyama, Ney Sussumu; Dias, Luiz Antonio dos Santos; Oliveira, Antônio Carlos Baião deCem acessos de café pertencentes ao Banco de Germoplasma de Coffea spp. da Universidade Federal de Viçosa foram caracterizados agronômica e morfologicamente, e divididos em grupos de acordo com suas correlações genéticas. Utilizou-se 21 descritores do IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute). Após a caracterização procederam-se as análises estatísticas que indicaram, na ordem, as seguintes variáveis para descarte, por serem menos relevantes para o agrupamento genético: número de nós no ramo plageotrópico, número de nós na haste principal, cor de fruto, estimativa comparativa de produção de frutos, comprimento do ramo plageotrópico, diâmetro da copa, comprimento da folha, uniformidade de maturação dos frutos e comprimento do ramo plageotrópico até o primeiro nó. Além disso, os descritores formato da folha e formato do ápice da folha foram descartados por não apresentarem variação nos acessos avaliados. Assim, das 21 características inicias, apenas 10 foram mantidas ao final da análise. Com as 21 características os 100 acessos foram separados em 78 grupos distintos, 67 deles sendo grupos singulares. Em contrapartida, após o descarte das variáveis menos relevantes, as 10 características permitiram a formação de 10 grupos, sendo apenas 1 singular.Item Marcadores microssatélites para Coffea arabica L.(Universidade Federal de Viçosa, 2008-07-21) Missio, Robson Fernando; Sakiyama, Ney Sussumu; Caixeta, Eveline Teixeira; Zambolim, Eunize Maciel; Dias, Luiz Antônio dos SantosOs marcadores microssatélites (SSR) são desejáveis para estudos genéticos e seleção assistida por marcadores. A limitada disponibilidade destes marcadores para Coffea arabica, uma das principais culturas em importância sócio-econômica do mundo, justifica novos esforços para o desenvolvimento de marcadores SSR. Portanto, o objetivo deste trabalho foi desenvolver, caracterizar e avaliar a utilização de marcadores SSR para estudos da diversidade genética em Coffea. Duas bibliotecas genômicas enriquecidas para as sequências repetidas (GT) 15 e (AGG) 10 foram construídas, utilizando-se o DNA genômico do genótipo Bourbon Amarelo UFV 570. Um total de 756 clones positivos, com seqüências de boa qualidade, foi utilizado para a localização de 287 SSR e o desenho de 96 pares de primers SSR. Aproximadamente 15% dos clones foram redundantes. As repetições de dinucletídeos foram mais freqüentes que os tri- e tetranucleotídeos, sendo as classes AG (32,8%), AC (12,9%), AAG (9,8%) e AGG (5,6%) as mais abundantes na porção analisada do genoma de C. arabica. Em média, foi encontrado um SSR a cada 1,45kb. Do total de 96 primers SSR desenhados e sintetizados, 90 (94%) foram validados como marcadores SSR úteis para estudos genéticos em C. arabica, sendo 21 (23%) polimórficos entre os cafeeiros Híbrido de Timor UFV 445-46 e Catuaí UFV 2143-235. Trinta e três primers SSR foram analisados em 24 acessos de Coffea importantes para o programa de melhoramento da UFV/EPAMIG. O número médio de alelos por primer foi de 5,1 e os valores médios de PIC foram de 0,56 para C. canephora e de 0,22 para C. arabica, variarando de 0,08 a 0,79 entre todos os acessos avaliados. Neste trabalho, também, foi comparada a eficiência de 18 marcadores SSR genômicos e 17 EST-SSR para o estudo da diversidade genética em Coffea. O número médio de alelos/primer foi de 5,1 e 5,3 para os marcadores EST-SSR e SSR genômico, respectivamente. Os marcadores SSR genômicos apresentaram maior número de alelos exclusivos e foram mais polimórficos dentro e entre os grupos genéticos, quando comparado com os EST-SSR. Os SSR genômicos apresentaram também maiores coeficientes de dissimilaridade genética e maior número de alelos discriminantes e foram eficientes em distinguir todos os acessos estudados. Os resultados demonstraram o potencial dos marcadores SSR genômicos na detecção do nível de polimorfismo, dos alelos exclusivos e da dissimilaridade genética, viitornando-os úteis para estudos de diversidade genética em Coffea, principalmente em C. arabica que apresenta pequena variabilidade genética. Este trabalho aumentou o número de marcadores SSR disponíveis para estudos genéticos em C. arabica e espécies relacionadas do gênero Coffea importantes para o melhoramento genético.Item Resistance to bacterial halo blight in Arabica coffee lines derivative from the genotype C1195-5-6-2 under natural infection conditions(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2018) Andreazi, Elder; Sera, Gustavo Hiroshi; Sera, Tumoru; Fonseca, Inês Cristina de Batista; Shigueoka, Luciana Harumi; Santos, Willian Gabriel dos; Pereira, Carlos Theodoro MottaThe aim of this study was to identify resistance to bacterial halo blight in Arabica coffee lines carrying Coffea racemosa genes. Eighteen Arabica coffee lines derivative from the genotype C1195-5-6-2, and the cultivars IAPAR 59 and IPR 99 were evaluated for resistance to bacterial halo blight in two trials carried out in field conditions, in Londrina, PR, Brazil. The cultivars Mundo Novo IAC 376-4 and Catuaí Vermelho IAC 81 were included as susceptible controls. Ten lines and the cultivar IAPAR 59 showed resistance to bacterial halo blight. The cultivar IPR 99 presented intermediate reaction, and the controls were very susceptible. This is the first study to show that lines derivative from the genotype C1195-5-6-2, which has C. racemosa genes, could be a source of resistance to bacterial halo blight in coffee breeding programs.Item Prediction of genetic gains from selection in Arabica coffee progenies(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2011-09-08) Oliveira, Antonio Carlos Baião de; Pereira, Antonio Alves; Silva, Felipe Lopes da; Rezende, Juliana Costa de; Botelho, César Elias; Carvalho, Gladyston RodriguesGains from selection for yield were estimated in Arabica coffee progenies carrying rust-resistance genes. The experiment in augmented block design was installed in Três Pontas, state of Minas Gerais. Three blocks were established with six plants per plot, spaced 3.50 x 0.90 m, in 96 regular (F2 progenies) and two control treatments. The plant response to rust was evaluated on a grade scale in 2008. Yield (bags per hectare) was estimated in the growing seasons 2005 to 2008. Significant differences between treatments for yield were observed in all harvests, except 2005. The presence of genetic variability among progenies allowed significant gain from selection for yield. Under the experimental conditions of this study, selection for yield can be performed in the first high-yield year, without major losses compared to genetic gain from selection for yield when based on the mean of four harvests.Item Isolation, characterization and amplification of simple sequence repeat loci in coffee(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2008-10-09) Cristancho, Marco-Aurelio; Gaitán, Álvaro-LeónSimple sequence repeat (microsatellite) loci in coffee were identified in clones isolated from enriched and random genomic libraries. It was shown that coffee is a plant species with low microsatellite frequency. However, the average distance between two loci, estimated at 127kb for poly (AG), is one of the shortest of all plant genomes. In contrast, the distance between two poly (AC) loci, estimated at 769kb, is one of the largest in plant genomes. Coffee (AC)n microsatellites are frequently associated with other microsatellites, mainly (AT)n motifs, while (AG)n microsatellites are not normally associated with other microsatellites and have a higher number of perfect motifs. Dinucleotide repeats (AG) and (AC) were found in ATrich regions in coffee. Sequence analysis of (AC)n microsatellites identified in coffee revealed the possible association of these repeated elements with miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs). In addition, some of the evaluated SSR markers produced transposon-like amplification patterns in tetraploid genotypes. Of 12 SSR markers developed, nine were polymorphic in diploid genotypes while 5 were polymorphic in tetraploid genotypes, confirming a greater genetic diversity in diploid species.Item Estimates of genetic parameters in Arabic coffee derived from the Timor hybrid(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2007-06-30) Mistro, Júlio César; Fazuoli, Luiz Carlos; Gallo, Paulo Boller; Oliveira, Antonio Carlos Baião de; Toma-Braghini, Masako; Silvarolla, Maria BernadeteGenetic parameters of Arabic coffee progenies derived from the cross Villa Sarchi x Timor hybrid were estimated in order to evaluate their potential for improvement. The experiment was installed in a random block design with ten treatments, eight replicates and eight plants per plot. The parameters cherry yield, plant height, canopy diameter, seed types and sizes were estimated. Results demonstrated significant differences between treatments for all traits. Greatest yield gains were achieved when the selection was performed based on plot means and in years of high yields. The variation index b was the best indicator of genetic variability. The progenies IAC 3786. IAC 3788, IAC 4094, IAC 4095, IAC 3425, and IAC 3429 were outstanding regarding the evaluated agronomic traits, representing progenies of high agronomic potential. All progenies presented leaf rust resistance.Item Otimização da experimentação no melhoramento do cafeeiro(Embrapa Café, 2023-09) Resende, Marcos Deon Vilela de; Alves, Rodrigo Silva; Oliveira, Antonio Carlos Baião de; Caixeta, Eveline Teixeira; Pereira, Antonio Alves; Mariz, Bruna Lopes